Ūkininkas, asmeninėms reikmėms vartodamas savos gamybos produkciją, privalo išsirašyti PVM sąskaitą faktūrą įkainodamas suvartotą produkciją sąlygine kaina. Metų pabaigoje, paskaičiavus produkcijos savikainą, susidaro kainų skirtumas, vadinasi, tam skirtumui reikia išsirašyti debetinę arba kreditinę PVM sąskaitą faktūrą ir patikslinti PVM.
Prekių tiekimu už atlygį laikomas prekių (kurių pirkimo (importo) PVM arba tokioms prekėms pasigaminti sunaudotų prekių (paslaugų) pirkimo PVM buvo įtrauktas į atskaitą) suvartojimas PVM mokėtojo privatiems poreikiams tenkinti, t. y. PVM mokėtojas turi apskaičiuoti nustatyto dydžio šių prekių pardavimo PVM.
Kaip nustatyta PVM įstatymo 15 straipsnyje, PVM mokėtojo privatiems poreikiams tenkinti suvartotų prekių apmokestinamoji vertė yra: įsigytų prekių – jų pirkimo kaina (išskyrus PVM), savos gamybos prekių – pasigaminimo savikaina (išskyrus PVM).
Prekių suvartojimo PVM mokėtojo privatiems poreikiams tenkinti atvejams įforminti naudojama PVM sąskaita faktūra, kurioje privalo būti nurodyta „Prekių suvartojimas privatiems poreikiams tenkinti“. Ji surašoma ne vėliau kaip iki PVM mokestinio laikotarpio PVM deklaracijos pateikimo. Kitaip tariant, kada prekes suvartoja, tada ir išsirašo PVM sąskaitą faktūrą.
Taigi, savos gamybos žemės ūkio produkcijai iš karto turi būti paskaičiuota pasigaminimo savikaina. Jei mokestinis laikotarpis mėnuo, tai kiekvieną mėnesį paskaičiuojamas ir sumokamas PVM.
Tačiau, vykdant žemės ūkio gamybą, žemės ūkio produkcijos pasigaminimo savikaina yra paskaičiuojama metų pabaigoje. Tokiu atveju metų gale galima išsirašyti vieną kreditinę PVM sąskaitą faktūrą ir patikslinti PVM. Tik reikia atsiminti, kad per mažai sumokėjus už tam tikrą laikotarpį (mėnesį ar pusmetį), reikės grįžti atgal ir patikslinti teiktas PVM deklaracijas. Atitinkamai gali atsirasti delspinigių. Jeigu buvo sumokėta per daug, permoką bus galima susigrąžinti.